Um sistema de protocolo mais avançado está sendo instalado em todos os órgãos governamentais para acompanhar todos os processos em trâmite, sendo que o cidadão poderá consultar o seu andamento tanto pelo disque-servidor (0800-6473633) quanto pela internet. O objetivo é otimizar os trabalhos, gerenciar melhor o tempo de serviço e ter um maior controle sobre os processos no Estado.
O sistema de protocolo nasceu da necessidade de centralizar as informações de processo com uma única numeração. Com sua instalação iniciada em janeiro de 2005, o programa já foi implantado em 29 órgãos, da administração direta e indireta. Antes, cada secretaria, cada órgão, tinha um sistema isolado de protocolo e isso causava transtorno no trabalho, pois quando o processo era encaminhado de um órgão a outro acabava ganhando uma nova numeração, dificultando assim o acompanhamento e localização deste.