A Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT) foi a única do Estado que conseguiu nota máxima no Exame Nacional de Desempenho dos Estudantes (Enade) de 2009. Os cursos de Administração e Direito ficaram conceito 5 na avaliação anual do MEC – Ministério da Educação e Cultura. Os cursos de faculdades e centros universitários particulares receberam nota 1.