Imagine uma equipe com a melhor ou entre as melhores campanhas da Primeira Fase, ser eliminada do Campeonato com uma simples derrota. Pois é exatamente esse risco que correm os times que tiveram a melhor performance até agora no Campeonato Mato-grossense 2011. Cumprindo o que determina o Estatuto do Torcedor, a FMF não pode alterar o regulamento, aprovado pelos dirigentes.
De acordo com os cruzamentos que vão originar os Grupos "C", "D", "E" e "F", os confrontos mais equilibrados – pela colocação na fase anterior – serão entre segundo e terceiro colocados dos grupos iniciais. Já os últimos colocados no G4 terão pela frente os primeiros de cada grupo (1º de A x 4º de B e 1º de B x 4º de A).
Desta forma os confrontos do mata-mata serão os seguintes:
Luverdense x Vila Aurora (primeiro jogo em Rondonópolis)
Cuiabá x REC (primeiro jogo em Rondonópolis)
Mixto x Barra (primeiro jogo em Cuiabá)
União x Sorriso (primeiro jogo em Sorriso)
Caso hajam resultados iguais, a decisão vai para os pênaltis. A única vantagem ficará por conta da classificação na fase anterior, que valerá o mando de campo no jogo de volta.